مقایسه ژنوتیپی جدایه‌های اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال جدا شده از ماکیان صنعتی ایران

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 استاد گروه بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

2 دانشیار گروه تحقیقات و تشخیص بیماری‌های طیور، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم‌رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

3 دانشجوی دکتری تخصصی بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

4 استادیار گروه تحقیقات و تشخیص بیماری‌های طیور، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم‌رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

چکیده

    اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال (ORT)، باکتری نوظهور بیماری­زای تنفسی است که خسارات اقتصادی مهمی را در صنعت طیور ایجاد می‌کند.  مطالعات قبلی در ایران شباهت‌های مولکولی و ژنتیکی بالایی را بین جدایه‌های ORT طی سال‌های 1999-2009، براساس SDS-PAGE، ERIC-PCR و تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد.  هدف از مطالعه حاضر تعیین ژنوتیپ جدایه‌های ORT به دست آمده از ماکیان صنعتی با استفاده از روش‌های تکثیر تصادفی پلی‌مورفیسم DNA (RAPD) و تعیین تیپ توالی‌یابی چندجایگاهی (MLST) بود.  در این مطالعه، از 30 باکتری ORT جدا شده از ماکیان صنعت طیور ایران در سال‌های 1379 تا 1395 تأیید شده به‌روش بیوشیمیایی و مولکولی استفاده شد.  آزمایش RAPD با استفاده از پرایمر OPG11 بر روی تمام نمونه‌های ORT مورد مطالعه انجام شد.  با توجه به نتایج آزمون RAPD از بین 30 جدایه ORT تنها 5 جدایه برای آزمون MLST انتخاب شدند که برای انجام آن، هفت جفت پرایمر برای تکثیر و توالی‌یابی ژن‌های خانه‌دار adk، aroE، fumC، gdhA، mdh،pgi  و pmi طراحی گردید.  در آزمون RAPD با استفاده از پرایمرOPG11 ، تعداد 9 ژنوتیپ متفاوت مشاهده شد.  توالی DNA الل‌های این هفت لوکوس، در خصوص هر 5 سویه ORT، با توالی آلل‌های موجود در بانک اطلاعاتی MLST مقایسه شدند.  چهار ORT از پنج جدایه مورد مطالعه متعلق به تیپ سکانسی 9 (ST9) بودند و یک سویه هم تیپ سکانسی جدیدی بود.  بر اساس یافته‌های این مطالعه، یک تیپ سکانسی جدید از ORT های طیور صنعتی در ایران گزارش گردید که پیش از این از سایر نقاط جهان گزارش نشده است.  مطالعات بعدی جهت بررسی تعداد بیش­تری از جدایه‌های ORT، می‌تواند در تشخیص تیپ‌های مختلف سکانسی و تیپ سکانسی غالب در کشور کمک‌کننده باشد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Alispahic, M., Endler, L., Hess, M., & Hess, C. (2021). Ornithobacterium rhinotracheale: MALDI-TOF MS and whole genome sequencing confirm that serotypes K, L and M deviate from well-known reference strains and numerous field isolates. Microorganisms, 9(5), 1006.
Allymehr, M. (2006). Seroprevalence of Ornithobacterium rhinotracheale infection in broiler and broiler breeder chickens in West Azerbaijan Province, Iran. Journal of Veterinary Medicine. A, Physiology, Pathology, Clinical Medicine, 53(1), 40-42.
Amonsin, A., Wellehan, J. F., Li, L. L., Vandamme, P., Lindeman, C., Edman, M., Robinson, R. A., & kaper, V. (1997). Molecular epidemiology of Ornithobacterium rhinotracheale. Journal of Clinical Microbiology, 35(11), 2894-2898.
Banani, M., Khaki, P., Goodarzi, H., Vandyousefi, J., & Pourbakhsh, S. A. (2000). Isolation and identification of Ornithobacterum rhinotracheale from a broiler and a pullet flock. Pajouhesh & Sazandegi, 13(1), 106-109. (In Persian)
Banani, M., Pourbakhsh, S. A., Erami, M., Gholamin, F., & Fatehmanesh, M. (2009). Diagnosis of Ornithobacterium rhinotracheale using polymerase chain reaction (PCR). Journal of Veterinary Research, 64(1), 41-45. (In Persian)
Banani, M., Pourbakhsh, S. A., & Khaki, P. (2001). Characterization of Ornithobacterum rhinotracheale from commercial chickens.  Archives of Razi Institute, 52(1), 27-36.
Barbosa, E. V., Cardoso, C. V., Silva, R. C. F., Cerqueira. A. M. F., Liberal, M. H. T., & Castro, H. C. (2020). Ornithobacterium rhinotracheale: An update review about an emerging poultry pathogen. Veterinary Science, 7(1), 3.
Chou, C. H., Lin, S. Y., Chen, C. L., & Tsai, H. J. (2009). Use of random amplified polymorphic DNA analysis and single enzyme amplified fragment length polymorphism in molecular typing of Ornithobacterium rhinotraceale strains. Avian Diseases, 53(1), 108-114.
Erganis, O., Hadimli, H. H., Kav, K., & Sayin, Z. (2013). Phenotypic and molecular characterization of strains of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from poultry in Turkey. African Journal of Microbiology Research, 7(2), 82-88.
Ghanbarpour, R., & Salehi, M. (2009). Sero-prevalence and identification of Ornithobacterium rhinotracheale in broiler flocks in south-eastern Iran. Tropical Animal Health and Production, 41(8), 1679-1683.
Ghodsian, N., Karimi, V., Banani. M., Bozorgmehri-Fard. M. H., Zahraei Salehi, T., & Pourbakhsh, S. A. (2013). The phylogenetic analysis of some Ornithobacterium rhinotracheale isolates from Alborz province commercial chicken flocks of Iran. Iranian Veterinary Journal, 8(4), 68-75.
Ha, H. J., Christensen, N., Humphrey, S., Haydon, T., Bernardi, G., & Rawdon, T. (2016). The First detection of Ornithobacterium rhinotracheale in New Zealand. Avian Diseases, 60(4), 856-859.
Hafez, H. M., & Chin, R. P. (2020). Ornithobacterium rhinotracheale infection. In: Diseases of Poultry. Swayne, D.E. et al. (eds). (14th ed.) Wiley-Blackwell Publication. NJ, USA. p. 853-860.
Hassanzadeh, M., Karimi, V., Fallah, N., & Ashrafi, I. (2010). Molecular characterization of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from broiler chicken flocks of Iran.  Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences, 34(4), 373-378
Leroy-Setrin, S., Flaujac, G., Thenaisy, K., & Chaslus-Dancia, E. (1998). Genetic diversity of Ornithobacterium rhinotracheale strains isolated from poultry in France. Applied Microbiology, 26(3), 189-193.
Mayahi, M., Gharibi, D., Ghadimipour, R., & Talazadeh, F. (2016). Isolation, identification and antimicrobial sensitivity of Ornithobacterium rhinotracheale in broilers chicken flocks of Khuzestan, Iran. Veterinary Research Forum, 7(4), 341-346.
Mirzaie, S., Hassanzadeh, M., Bozorgmehri Fard, M. H., & Banani, M. (2011). Isolation and characterization of Ornithobacterium rhinotracheale in turkey, quail flocks and domestic pigeons by bacteriological and molecular methods. Archives of Razi Institute, 66(2), 121-127.
Nisar, M., Thieme, S., Hafez, H. M., Sentíes-Cúe, G., Chin, R. P., Muhammad, S. P., Aboubakr, H., Goyal, S. M., & Nagaraja, K. V. (2020). Genetic diversity of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from chickens and turkeys in the United States. Avian Diseases, 64(3), 324-329.
Numee, S., Hauck, R., & Hafez, H. M. (2012). Detection and typing of Ornithobacterium rhinotracheale from German poultry flocks. Avian Diseases, 56(4), 654-658.
Özbey, G., Ertaş. H. B., & Muz. A. (2005). A random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Ornithobacterium rhinotracheale strains isolated from chickens in Turkey. Veterinary Medicine Czech, 50(12), 526-530.
Özbey, G., Öngör, H., Balik, D. T., Çelik, V., Kiliç, A., & Muz, A. (2004). Investigations on Ornithobacterium rhinotracheale in broiler flocks in Elazig Province located in the East of Turkey. Veterinary Medicine Czech, 49(8), 305-311.
Peña-Vargas, E. R., Vega-Sánchez, V., Morales-Erasto, V., Trujillo-Ruíz, H. H., Talavera-Rojas, M., & Soriano-Vargas, E. (2016). Serotyping, genotyping, and antimicrobial susceptibility of Ornithobacterium rhinotracheale isolates from Mexico. Avian Diseases, 60(3), 669-672.
Smith, E. A., Miller, E. A., Weber, B. P., Munoz Aguayo, J., Flores Figueroa, C., Huisinga, J., Nezworski, J., Kromm, M., Wileman, B., & Johnson, T. J. (2020). Genomic landscape of Ornithobacterium rhinotracheale in commercial turkey production in the United States. Applied and Environmental Microbiology, 86(11): e02874-19.
Subaaharan, S., Blackall, L. L., & Blackall. P. J. (2010). Development of a multi-locus sequence typing scheme for avian isolates of Pasteurella multocida. Veterinary Microbiology, 141(3-4), 354–361.
Szabó, R., Wehmann, E., Makrai, L., Nemes, C., Gyuris, E., Thuma, A., & Magyar, T. (2017). Characterization of Ornithobacterium rhinotracheale field isolates from Hungary. Avian Pathology, 46(5), 506-514.
Thieme, S., Mühldorfer, K., Gad, W., Lüschow, D. and Hafez, H. M. (2016a). Molecular characterization of the recently emerged poultry pathogen Ornithobacterium rhinotracheale by multilocus sequence typing. PLoS ONE, 11(9), e0163401.
Thieme, S., Hafez, H. M., Gutzer, S., Warkentin, N., Lüschow, D., & Mühldorfer, K. (2016b). Multilocus sequence typing of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from pigeons and birds of prey revealed new insights into its population structure. Veterinary and Animal Science, 1, 15-20.
Tsai, H., & Huang, C. (2006). Phenotypic and molecular characterization of isolates of Ornithobacterium rhinotracheale from chickens and pigeons in Taiwan. Avian Diseases, 50(4), 502-507.
Umali, D. V., Shirota, K., Sasai, K., & Katoh, H. (2018). Characterization of Ornithobacterium rhinotracheale from commercial layer chickens in eastern Japan. Poultry Science, 97(1), 24-29.
Veiga, I. M. B., Lüschow, D., Gutzer, S., Hafez, H. M., & Mühldorfer, K. (2019). Phylogenetic relationship of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from poultry and diverse avian hosts based on 16S rRNA and rpoB gene analyses. BMC Microbiology, 19(1), 31.