نشریه دامپزشکی ایران

نشریه دامپزشکی ایران

ژنوتایپینگ مجتمع عمده پذیرش بافتی طیور با روش تحلیل دقیق دمای شکافت

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 دانشجوی دکترای تخصصی ایمنی‌شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
2 استاد گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران
3 استادیار گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
چکیده
    مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) در طیور با عنوان جایگاه ژنی B یا گروه خونی سرولوژیکی مسئول کنترل مقاومت به بیماریها از جمله بیماریهای خود ایمن، ویروسی، باکتریائی و انگلی است.  ریزماهواره LEI0258 به عنوان یک شاخص معتبر برای تایپینگ MHC بافتی طیور می‌تواند برای تعیین هویت جمعیت­ های مختلف و ویژگی­ های فردی یا نژادی در مطالعات آکادمیک و کاربردی استفاده شود.  در این تحقیق از روش‌ تحلیل دقیق دمای شکافت (HRM) برای تعیین ژنوتیپ‌های MHC مبتنی بر ریزماهواره LEI0258 طیورگوشتی نژاد Ross 308  استفاده شد.  بدین منظور ابتدا ژنوتیپ‌ها با روش‌های معمول PCR و الکتروفورز و همچنین تحلیل قطعه­ ای مشخص شدند و سپس نتایج روش معمول با نتایج آزمون HRM مورد مقایسه و بررسی قرار گرفتند.  از تعداد 100 نمونه 5 ژنوتیپ در آزمون‌های معمول PCR و الکتروفورز و همچنین تحلیل قطعه­ ای مشخص شدند. این ژنوتیپ‌ها شامل آلل‌های با وزن ملکولی 448، 385، 300 و 207 جفت باز بودند.  در تحلیل  HRM، تغییرات فلورسانس نرمال‌شده نسبت به دما (درجه سانتی ­گراد) برای پنج ژنوتیپ مختلف بررسی شد.  نتایج نشان داد که روش HRM قادر است ژنوتیپ‌های مختلف و موارد هوموزیگوت و هتروزیگوت را تفکیک کند.  در مجموع به نظر می‌رسد روش تحلیل دقیق دمای شکافت را بتوان برای بررسی تنوع ژن‌های MHC طیور به کار برد.  اگرچه با این روش نمی‌توان دقیقا آلل‌های هر کرومزوم را تشخیص داد ولی با توجه به ماهیت هم‌بارز ژن ­های MHC نتایج برای بررسی ترکیب ژنتیکی و تعیین ژنوتیپ‌ها قابل قبول خواهند بود.
کلیدواژه‌ها

موضوعات


Abdel karim, H. D., & Noori, A. A. (2025). Relationship of Lei0234 marker with some productive traits of local chickens. Iraqi Journal of Agricultural Sciences, 56(4), 1273–1285.
Alkafajy, A., Al-Karagoly, H., & Brujeni, G. N. (2020). Comparison of cattle BoLA-DRB3 typing by PCR-RFLP, direct sequencing, and high-resolution DNA melting curve analysis. Veterinary Research Forum, 11(1), 21–26.
Ben Salah, H., Jelassi, R., Zidi, I., Ben Amor, A., Bizid, S., Ammi, R., Guizani, L., Bouratbine, A., Aoun, K., & Chelbi, H. (2021). Rapid high-resolution melting method to identify human leukocyte antigen-G (HLA-G) 3′ untranslated region polymorphism +3142C/G (rs1063320). Molecular Genetics and Genomic Medicine, 9(11), e1817.
Boonyuen, U., Jacob, B. A. C., Chamchoy, K., Pengsuk, N., Talukam, S., Petcharat, C., Adams, E. R., Edwards, T., Boonnak, K., Amran, S. I., Ab Latif, N., & Louis, N. E. (2025). Improved genetic screening with zygosity detection through multiplex high-resolution melting curve analysis and biochemical characterisation for G6PD deficiency. Tropical Medicine and International Health, 30(5), 437–457.
Costamilan, C. A. da V. L. R., Paludo, E., Herkenhoff, M. E., Pértille, F., de Souza, A. L. S., Mendes, C. R., & Dilarri, G. (2025). Immunogenetic diversity of MHC class II B-Lβ genes in Brazilian Caipiras (free-range) chickens laying blue eggs. Frontiers in Immunology, 16 (10), e.1644110.
Fulton, J. E. (2020). Advances in methodologies for detecting MHC-B variability in chickens. In Poultry Science. 99(3): 1267–1274.
Fulton, J. E., Juul-Madsen, H. R., Ashwell, C. M., McCarron, A. M., Arthur, J. A., O’Sullivan, N. P., & Taylor, R. L. (2006). Molecular genotype identification of the Gallus gallus major histocompatibility complex. Immunogenetics, 58(5–6), 407–421.
Fulton, J. E., Lund, A. R., Mccarron, A. M., Pinegar, K. N., Korver, D. R., Classen, H. L., Aggrey, S., Utterbach, C., Anthony, N. B., & Berres, M. E. (2016). MHC variability in heritage breeds of chickens. Poultry Science, 95(2), 393–399.
Goto, R. M., Afanassieff, M., Ha, J., Iglesias, G. M., Ewald, S. J., Briles, W. E., & Miller, M. M. (2002). Single-strand conformation polymorphism (SSCP) assays for major histocompatibility complex B genotyping in chickens. Poultry Science, 81(12), 1832–1841.
Manjula, P., Perera, D., Fernando, R., Kim, M., Cho, E., & Lee, J. H. (2025). Investigation of MHC-B Linked LEI0258 Marker Diversity in Various Chicken Populations. Journal of Animal Science and Technology. 10 (5), e2500118.
Mehrzad, J., & Houshmand, P. (2025). Immunogenetics Properties of Avian MHC Polymorphism and its Association with Diseases and Production Traits. Journal of Poultry Sciences and Avian Diseases, 3(3), 40–46.
Moussa Hassan, O., Machuka, E., Martina, K., Keambou Tiambo, C., Domelevo Entfellner, J.-B., & Pelle, R. (2023). Major Histocompatibility Complex Region and Diversity of the Local Chicken Populations In Niger. Journal of World’s Poultry Science, 2(4), 47–54.
Oladejo, O. A., Oseni, S. O., Kyallo, M., Entfellner, J. B. D., Tor, N. E., Tiambo, C. K., & Pelle, R. (2023). Evaluation of Genetic Variability in Four Nigerian Locally-Adapted Chicken Populations Using Major Histocompatibility Complex-Linked LEI0258 Microsatellite Marker. Poultry Science Journal, 11(2), 189–201.
Ramezani, A., Brujeni, N. G., Sheikhi, N., & Asadollahi, P. K. (2024). MHC-linked microsatellite LEI0258 variability and population structure of chicken ecotypes in Iran. Iranian Journal of Veterinary Research, 25(4), 312–318.
Słomka, M., Sobalska-Kwapis, M., Wachulec, M., Bartosz, G., & Strapagiel, D. (2017). High resolution melting (HRM) for high-throughput genotyping-limitations and caveats in practical case studies. International Journal of Molecular Sciences, 18(11), 2316.
Vahedi, S. M., Jamshidi, S., Lankarani Mohajer, L., & Nikbakht Brujeni, G. (2018). Allelic descrimination of canine MHC (DLA-DRB1) by high resolution melt analysis. Journal of Veterinary Research, 73(1), 93–100.
Yu, S., Cheng, Y., Tang, C. C., & Liu, Y. P. (2025). Diagnostic accuracy of high-resolution melting curve analysis for discrimination of oncology-associated EGFR mutations: a systematic review and meta-analysis. Journal of International Medical Research, 53(2), 1–15.
Zhou, Y., Ha, S., Xu, Y., Qin, X., Ma, Y., Lu, J., Wang, B., Cai, J., Duan, Z., Cong, B., Chen, J., & Deng, J. (2025). Establishment of a simple prediction method for DNA melting temperature: high-resolution melting curve analysis of PCR products. PLoS One, 20(4):e0321885.