تنوع ژنتیکی عقرب هوتنتوتا زاگروسنسیس و سلسئی با استفاده از تکنیک (RAMS (Random Amplified Microsatellites در خوزستان

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانش‌آموخته‌ی دکترای تخصصی بیوشیمی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهیدچمران اهواز، اهواز، ایران

2 دانشیار گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

3 مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم‌سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اهواز، ایران

چکیده

    عقرب­های خانواده بوتیده دارای جنس­های متنوعی در جهان و از جمله در ایران­اند که یکی از آن­ها جنس هوتنتوتا است.  علی­رغم این که این عقرب یکی از چند عقرب مهم از لحاظ پزشکی است، تا کنون مطالعه­ی ملکولی در خصوص روابط فیلوژنتیکی آن در ایران صورت نگرفته است.  در این مطالعه، 10 نمونه­ از هر کدام از عقرب­های گونه هوتنتوتا زاگروسنسیس و سلسئی از مناطق مختلف استان خوزستان جمع­آوری گردید و سپس جهت بررسی­ تنوع ژنتیکی با استفاده از تکنیکRAMS (Random Amplified Microsatellites) و PCR-RFLP مورد مطالعه قرار گرفتند.  آغازگر P-CCA از بین 6 آغازگر RAMS که به کمک واکنش PCR مورد استفاده قرار گرفت، باندهای واضح و تکرارپذیری تولید کرد.  از 20 نمونه عقرب هوتنتوتا زاگروسنسیس و سلسئی تعداد کل 78 باند تولید شد که از این تعداد باندهای پلی­مورفیک و مونو مورفیک به ترتیب، 8/94 و 2/5 بودند.  اندازه­ی باندهای تولید شده با استفاده از این آغازگر بین 200 تا 1000 نوکلئوتید متفاوت بود.  پس از امتیازدهی الگوی باندهای حاصله بر روی ژل الکتروفورز، گروه­بندی نمونه­ها با استفاده از ضریب شباهت دایس و الگوریتم UPGMA انجام شد.  نتایج دندروگرام نشان داد که نمونه­های مربوط به هوتنتوتا زاگروسنسیس و سلسئی با ضریب تشابه به ترتیب، 65/0 و 60/0 در یک گروه قرار گرفتند، هرچند که ناهمگونی بین نمونه­های دو گونه مشاهده شد.  دو نمونه گردآوری شده از دزفول (HZ9 و SE5) از بقیه­ی نمونه­های هم­گروه خود کاملاً متفاوت بودند، که این نتیجه به وسیله­ی آزمایش PCR-RFLP مورد تأیید قرار گرفت.  نتایج حاصل از تحلیل دندروگرام تنوع و جدایی ژنتیکی درون گونه­ای اعضای جمعیت عقرب جنس هوتنتوتا در استان خوزستان را نشان داد.  این مطالعه کاربرد استفاده از تکنیک RAMS به عنوان ابزاری به منظور بررسی تنوع ژنتیکی عقرب­ها در این منطقه را نشان می­دهد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Altschul, S.F.; Gish, W.; Miller, W.; Myers, E.W. and Lipman, D.J. (1990). Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology, 215(3): 403-410.
Dehghani, R.; Motevali Haghi, F.; Mogaddam, M.; Sedaghat, M.M. and Hajat, H. (2016). Review study of scorpion classification in Iran. Journal of Entomology and Zoology Studies, (4): 440-444. 
Dice, L.R. (1945). Measures of the amount of ecologic association between species. Ecology, 26(3): 297-302.
Edgar, R.C. (2004). MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Res, 32: 1792-1797.
Fet, V.; Gantenbein, B.; Gromov, A.V.; Lowe, G. and Lourenco, W.R. (2003). The first molecular phylogeny of Buthidae (Scorpiones). Euscorpius, 4: 1-10.
Gantenbein, B; and Largiader, C.R. (2003). The phylogeographic importance of the Strait of Gibraltar as a gene flow barrier in terrestrial arthropods: a case study with the scorpion Buthus occitanus as model organism. Molecular Phylogenetics and Evolution, 28: 119-130.
Hantula, J.; Dusabenyagasaniy, M.; and Hamelin, R.C. (1996). Random amplified microsatellites (RAMS) - a novel method for characterizing genetic variation within fungi. Eur. J. For. Path, 26: 159-166.
Jafari, H.: Saalabi, F.; Jelodar, A.; Navidpour, S.H.; Jahanifard, E. and Forouzan, A. (2017). Phylogenetic study on Orthochirus iranus by using morphological and molecular methods (Scorpiones: Buthidae). Journal of Entomology and Zoology Studies, 6(3): 304-309.
Jolodar, A. (2019). Molecular Characterization and Phylogeny Analysis Based on Sequences of Cytochrome Oxidase gene From Hemiscorpius lepturus of Iran.  Iran J. Vet. Med, 13 (1): 59-67.
Jolodar, A.; Masoudi, A.R.; Mehrzadi, S. and Davoudi, A. (2013). A. Molecular identification of peptide toxin MeBTX from the Iranian scorpion Mesobuthus eupeus. Iranian Journal of Veterinary, 9 (2): 24-33.
Kovarik, F. (2007). A revision of the genus Hottentotta Birula, 1908, with descriptions of four new species (Scorpiones, Buthidae). Euscorpius, 58: 1-107.
Lamoral, B.H. (1979). The scorpions of Namibia. Annals of the Natal Museum, 23: 497-784.
Mirshamsi, O.; Sari, A.; Elahi, E. and Hosseinie, S. (2010). Phylogenetic relationships of Mesobuthus eupeus (C.L. (Koch, 1839) inferred from COI sequences (Scorpiones: Buthidae). The Journal of Natural History, 44: 2851.
Mirshamsi, O. (2011). Mesobuthus eupeus (Scorpiones: Buthidae) from Iran: A polytypic species complex. Zootaxa, 2929: 1-21.
Nejati, J., Mozafari, E.; Saghafipour, A. and Kiyani, M. (2014). Scorpion fauna and epidemiological aspects of scorpionism in southeastern Iran. Asian Pac J Trop Biomed, 4(1): S217-S221.
Nikkhah, N.; Jolodar, A. and Taghavi Moghadam, A. (2018). Phylogenetic analysis of cytochrome oxidase subunit 1 from the Mesobuthus eupeus (Scorpions: Buthidae) of Khuzestan province. Iranian Veterinary Journal, 14: 102-111.
Oliveira, R.P.; Macedo, A.M.; Chiari, E. and Pena S.D.J. (1997). An alternative approach to evaluating the intraspecific genetic variability of parasites. Parasitol Today, 5:196-200.
Ozkan, O.; Adiguzel, S.; Kar, S.; Kurt, M.; Yakistiran, S.; Cesaretli, Y.; Orman, M. and Karaer, K.Z. (2007). Effects Of Androctonus crassicauda (Olivier, 1807) (Scorpiones: Buthidae) venom on rats: correlation among acetyl cholinesterase activities and electrolytes levels. Journal of Venomous Animals and Toxins including Tropical Diseases, 13(1): 69–81.
Sneath, P.H.A. and. Sokal, R.R. (1973). Numerical taxonomy. W.H. Freeman and Company, San Francisco.
Sousa, P.; Froufe, E.; Alves, P.C. and Harris; D.J. (2011). Genetic diversity within scorpions of the genus Buthus from the Iberian Peninsula: mitochondrial DNA sequence data indicate additional distinct cryptic lineages. Journal of Arachnology, 38 (2): 206-211.
Sousa, P.; Froufe, E.; Harris, D.J.; Alves, P.C. and Van der Meijden, A.  (2011). Genetic diversity of Maghrebian Hottentotta (Scorpiones: Buthidae) scorpions based on CO1: new insights on the genus phylogeny and distribution. African Invertebrates, 52 (1): 135-143.
Vachon, M. (1974). Etude des caracteres utilises pour classer les familles et les genres de Scorpions (Arachnides). 1. La trichobothriotaxie en arachnologie. Sigles trichobothriaux et types de trichobothriotaxie chez les scorpions. Bulletin du Museum National dHistoire Naturelle, 3: 857-958.
Weber, J.L. (1990). Informativeness of human (dC-dA)n (dG-dT)n polymorphisms. Genomics, 7: 524-530.
Wu, K,S,; Jones, R.; Danneberger, L. and Scolnik, P.A. (1994). Detection of microsatellite polymorphisms without cloning. Nucleic Acids Res, 22: 3257-3258.
Zietkiewicz, E.,; Rafaeski, A. and Labuda, D. (1994). Genome Fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20: 176-183.