@article { author = {}, title = {Compare of two methods of direct PCR and PCR with DNA extraction in Clostridium Perfringens typing}, journal = {Iranian Veterinary Journal}, volume = {8}, number = {4}, pages = {5-12}, year = {2013}, publisher = {Shahid Chamran University of Ahvaz}, issn = {1735-6873}, eissn = {2676-704X}, doi = {}, abstract = {    Polymerase chain reaction (PCR) is a suitable method for detecting pathogenic agents and first step in this process is DNA extraction. DNA extraction enumerate as a long stage in molecular genetic researches that is longer than total PCR process in some cases. The aim of this research is use of direct PCR (without DNA extraction) for different typing of Clostridium perfringens. In this study direct PCR and also PCR by extracted DNA was implemented on the A, B, C and D types of Clostridium perfringens. For this purpose four pairs of specific primers that were complementary with parts of the genes encoding α, β, ε and ι toxins of this bacterium were used. In both direct PCR and PCR by extracted DNA, 196, 324 and 655 bp fragments were amplified that are dependent to α, β and ε toxins respectively. Upshot different strains of this bacterium were identified based on amplified fragment length in PCR. The result showed that success of PCR is simple from colony directly and quality of created bands is the same in both methods. Therefore, use of this method is recommended because the direct PCR reduce time, steps and cost of PCR and provide possibility of testing many samples in shorter times provides.}, keywords = {Clostridium perfringens,DNA Extraction,Direct PCR}, title_fa = {مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استفاده از روش استخراج DNA در تعیین تیپ‌های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس}, abstract_fa = {     واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماری‌زا محسوب می‌شود و جداسازی DNA اولین گام در این مسیر است.  استخراج DNA یک مرحله وقت‌گیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار می‌آید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام PCR طولانی‌تر است.  هدف از انجام این تحقیق، استفاده از PCR مستقیم (بدون استخراج DNA) جهت تعیین تیپ‌های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس می‌باشد.  در این تحقیق PCR مستقیم و همچنین PCR با DNA استخراج شده بر روی چهار تیپ A، B، C و D باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس انجام شد، که برای این هدف از چهار جفت پرایمر اختصاصی که مکمل بخش‌هایی از ژن‌های کد‌ کننده توکسین‌های آلفا، بتا، اپسیلون و یوتای این باکتری بودند استفاده گردید.  در هر دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراج شده، قطعات 196، 324 و 655 جفت بازی سنتز گردید که به ترتیب مربوط به توکسین آلفا، بتا و اپسیلون می‌باشند.  در نهایت براساس طول قطعات سنتز شده در PCR، تیپ‌های مختلف این باکتری تشخیص داده شدند.  نتایج این تحقیق نشان می‌دهد که انجام PCR به طور مستقیم از کلونی بسیار ساده است و کیفیت باند ایجاد شده در PCR مستقیم و PCR با DNA استخراج شده با هم تفاوتی ندارند.  بنابراین با توجه به اینکه استفاده از PCR مستقیم زمان، مراحل و هزینه PCR را کاهش می‌دهد و امکان آزمون تعداد زیادی نمونه را در زمان کوتاهتری فراهم می‌آورد، استفاده از این روش توصیه می‌گردد.}, keywords_fa = {کلستریدیوم پرفرینجنس,استخراج DNA,PCR مستقیم}, url = {https://www.ivj.ir/article_2866.html}, eprint = {https://www.ivj.ir/article_2866_ebeb9483b530f8660d6799f9bc078d28.pdf} }